PrestaShop utilizza una struttura di gestione delle funzionalità dinamiche molto semplice ed efficace dividendo il lavoro tra un "Back Office" che provvede al controllo delle funzionalità ed alla gestione dei contenuti del negozio virtuale e una sezione "Front Office" dove le funzionalità sono applicate attraverso la visualizzazione al cliente delle pagine del sito. 
Grazie all'uso dei fogli di stile CSS e di moduli gestiti con blocchi all'interno delle pagine è possibile personalizzare l'interfaccia delle pagine e renderla più fluida ed accattivante. 
PrestaShop necessita di un Web Server (Apache 1.3 o superiore, IIS 6 o superiore), PHP 5.0 o superiore e MySQL 5.0 o superiore.

Le principali caratteristiche del Front office sono:

• Offerte speciali: riduzioni di prezzo, buoni regalo;
• Prodotti in primo piano sull' home page: lista produttori, venditori, nuovi elementi;
• Cross-selling: vendita accessori dei prodotti in modalità separata o integrata al prodotto;
• Prodotti: zoom immagine del prodotto, monitoraggio prodotti, costo imballaggio e spedizione, eco-tassa;
• Clienti: abbonamento e account utente, fattura in formato PDF, newsletter;
• Metodi di pagamento illimitati: pagamento da bonifico bancario, Cash-On-Delivery (COD), PayPal;
• Vendita di servizi e beni virtuali;
• Localizzazione dello shop su Googlemap;
• Feed RSS e opzione "Pick up in-store";

Tra le caratteristiche principali del pannello di amministrazione del Back office ci sono:

• Categorie e sottocategorie illimitate;
• Editor di testo WYSIWYG full-optional con file manager;
• Attributi, specifiche e immagini dei prodotti illimitate: ridimensionamento automatico delle immagini e funzioni di ottimizzazione;
• Impostazioni fiscali illimitate: valute con tassi di cambio in tempo reale, imposte, paesi, zone, provincie, tasse;
• Gestione degli sconti sulle quantità;
• Gestione catalogo ed inventario dei prodotti: gestione codici a barre;
• Aggiornamento veloce dei prodotti;
• Gestione dei moduli: aggiunta, eliminazione, funzionalità;
• Notifica dello stato di consegna personalizzabile;
• Gestione delle lingue illimitate;
• Localizzazione del cliente su Google Map;
• Search Engine Optimization (SEO, Friendly URL / permalink);
• Temi grafici completamente modificabili;
• Autorizzazione utenti;
• Importo minimo per ordine;
• Newsletter con esportazione dei contatti;
• Contenuti esportabili in formato CSV;